По результатам оценки результативности научных организаций присвоена 2-я категория (приказ ФАНО России № 157 от 30.03.2018).
10 декабря 2021 года доктор биологических наук Воронин Виктор Иванович переизбран директором СИФИБР СО РАН.
Сибирский институт физиологии и биохимии растений организован в 1961 году на базе Отдела биологии при Восточно-Сибирском филиале АН СССР под названием Восточно-Сибирский биологический институт СО АН СССР.
Основателем и первым директором (1950-1976 гг.) был член-корреспондент АН СССР Ф.Э. Реймерс. В состав института численностью 112 человек (в том числе 3 доктора и 17 кандидатов наук) входило 6 лабораторий и экспериментальная база. Основные направления исследований тех лет охватывали проблемы физиологии и биохимии растений, микробиологии и почвоведения, энтомологии, ботаники, геоботаники и лесоведения.
Современное название институт получил в декабре 1966 г. после реорганизации.
С 1976 года по 2002 год институт возглавлял член-корреспондент РАН Р.К. Саляев.
В настоящее время директором института является д.б.н., профессор В.К. Войников.